A Estação Ecológica de Santa Maria foi criada em 1985 em área desmembrada da Estação Experimental de São Simão. A vegetação natural está presente em mais de 80% da área total da unidade. A Savana é a vegetação predominante que associada à Floresta Estacional, caracteriza a região como de transição entre os biomas Mata Atlântica e Cerrado. Dentre a flora conhecida, ocorrem espécies presentes em alguma das listas de espécies ameaçadas de extinção, como a caroba-amarela, o cedro-rosa, a canela e a sucupira-preta. Quanto à fauna, foram registradas 120 espécies de aves e duas espécies de primatas, o sagui-de-tufos-pretos ou mico-estrela e o sauá. Algumas espécies de aves se reproduzem na região, mas migram para o Brasil Central ou Amazônia durante a estação seca (maio-agosto): bem-te-vi-rajado, tesourinha, juruviara e bigodinho. O ribeirão Tamanduá, afluente do rio Pardo, é o principal corpo hídrico da Estação Ecológica de Santa Maria, cortando a unidade de conservação no sentido Sul-Norte.