A área delimitada como PE Rio do Peixe abrange municípios que possuem o rio como limite territorial: Ouro Verde, Dracena, Presidente Venceslau, Piquerobi.
Criado em 2002, com 7.720 ha, é fruto de compensação ambiental em razão dos impactos decorrentes da formação do lago da Usina Engenheiro Sérgio Motta. Juntamente com o PE Aguapeí, cumpre a função de preservar os últimos trechos de ecossistemas de várzeas, que existiam em grande parte dos rios paulistas que desembocavam no rio Paraná.
Com características semelhantes ao Pantanal, esse trecho do rio do Peixe é conhecido como: ‘Pantaninho Paulista’. É ainda um dos últimos locais em São Paulo onde reside o cervo-do-pantanal (Blastocerus dichotomus), mamífero ruminante, encontrado em pântanos de alta vegetação. São os maiores veados da América do Sul, chegando a medir a 2 metros de comprimento.
A avifauna do Parque é muito rica, existindo várias espécies ameaçadas de extinção. O destaque vai para a Anhuma, cientificamente muito pouco estudada.