O Núcleo Cedro é o núcleo administrativo do Parque, mesmo quando ainda se tratava do Parque de Jacupiranga. A área do núcleo possui infraestrutura para alojamentos de funcionários e pesquisadores, viveiro de mudas construído para atender às demandas de compensações de infrações ambientais, além de espaço de convivência para palestras, cursos, oficinas e outros eventos. Há também uma trilha interpretativa, chamada Trilha do Aríete, que visa atividades de educação ambiental pertinentes ao uso público. Nessa trilha, pode ser avistado o papagaio-de-peito-roxo, ave símbolo do Parque e espécie ameaçada de extinção por causa da caça, do contrabando e da destruição de seu habitat. O núcleo Cedro é uma das áreas protegidas mais procuradas por observadores de aves, que procuram avistar não apenas os papagaios-de-peito-roxo, mas também outras espécies, como papa-taocas-do-sul, beneditos-de-testa-amarela, bicos-de-pimenta, catirumbavas, choquinhas-lisas, uiraçus-falsos, gaviões-reais e socozinhos.