Criado em 1998, o Núcleo São Sebastião do Parque Estadual da Serra do Mar (PESM), possui extensão de 26.268 hectares e abrange cerca de 70% do município de São Sebastião e uma pequena porção do Município de Caraguatatuba. No final de 2010, com a ampliação do PESM, importantes áreas foram incorporadas ao Núcleo São Sebastião, como parte da Praia de Boiçucanga, a praia Brava, incluindo o costão rochoso até Maresias, além das penínsulas localizadas entre as praias de Maresias, Paúba, Santiago (incluindo parte da Praia de Santiago), Toque-Toque Pequeno e Calhetas.
Dessa forma, o parque, e, por consequência, o Núcleo São Sebastião, ampliou a sua proteção para outros ecossistemas, como os costões rochosos, importantes ambientes para a alimentação e abrigo de espécies marinhas e que é responsável por parte da conexão entre os ecossistemas marinhos e terrestres.