O Núcleo Caraguatatuba surgiu em 1977, incorporado ao Parque Estadual Serra do Mar. A área do núcleo era categorizada como Reserva desde o ano de 1956.
A reserva, em 1962, foi transformada no Parque Estadual de Caraguatatuba, ampliando seus limites. Seus 35.947 hectares representam pouco mais de 10% de todo o território do PE da Serra do Mar.
Exuberantes paisagens formam os remanescentes de mata atlântica presentes no Núcleo, como os mananciais da represa de Paraibuna, as matas de encosta, os rios, as cachoeiras e os belíssimos cenários vistos da rodovia dos Tamoios e da estrada do Rio Pardo.
Três municípios paulistas fazem parte do núcleo: Caraguatatuba, Natividade da Serra e Paraibuna.
Seu nome, homônimo à cidade litorânea, tem referência na planta caraguatá (Bromelia pinguin), que significa “planta espinhosa” na língua tupi. O termo “tuba”, que equivale a “muito”, completa a palavra e seu sentido: região onde existem caraguatás em abundância.