Foi criada para proteger os recursos hídricos e o patrimônio ambiental da região representado pela paisagem constituída por vegetação formada por pastagens, culturas perenes e temporárias, capoeiras e remanescentes preservados de mata atlântica. Abriga mamíferos como jaguatiricas, suçuaranas, preguiças, bugios, gatos-do-mato-pequeno, gatos-maracajá e lontras. E ainda espécies em risco de extinção, como os gaviões-de-penacho. Destina-se também a proteger as cachoeiras, em especial, a Cachoeira dos Pretos e os promontórios, como a Pedra Grande, em Atibaia, e a Pedra Bela, no município de mesmo nome. Possui potencial para as pesquisas científicas. A região envolve as sub-bacias dos rios Atibainha, Atibaia, Jaguari e Camundacaia, todas tributárias do rio Piracicaba, sendo que parte de suas vazões são desviadas para a bacia do rio Juqueri-Mirim. Essas bacias compõem o Sistema Cantareira, responsável pelo abastecimento de aproximadamente 60% da população da região metropolitana de São Paulo.