A APA Represa Bairro da Usina corresponde à barragem do Rio Atibaia, responsável pela regularização de sua vazão, além de atuar no controle de enchentes e geração de energia, situada a noroeste da cidade. A Usina Hidrelétrica de Atibaia foi construída em 1928 e chegou a atender durante o período de operação, além de toda cidade de Atibaia, as cidades de Jarinu, Bragança Paulista e Bom Jesus dos Perdões. Encerrou as atividades em 1970, após a instalação da Companhia Energética de São Paulo (CESP), na cidade. Em razão da qualidade ambiental, em 1986, a região da Represa da Usina foi declarada área de preservação ambiental, com o objetivo de proteger os mananciais que ela representa para o abastecimento do município, bem como a paisagem dela resultante. Em sua região predominam atividades agrícolas, especialmente aquelas voltadas ao plantio de flores e frutos. A Represa da Usina é frequentada por praticantes de esportes náuticos, ideal para passeios de barco, ou apenas para contemplação.