A área da unidade é parte de uma gleba única de 2.000 alqueires (4.840 ha), adquirida em 1953. Criada como horto para a produção de lenha e madeira, passou à produção de pínus e depois a plantios experimentais. Em 2002, a unidade foi elevada à categoria de Floresta Estadual.r
A Floresta de Assis situa-se em área previamente ocupada por cerrado, predominando a fisionomia Cerradão.r
Ao longo dos córregos existem campos úmidos naturais (veredas), florestas paludícolas e matas ciliares, com espécies peculiares dessa condição ambiental. Extensas áreas anteriormente ocupadas por silvicultura de pínus e eucalipto foram convertidas para vegetação nativa de cerrado.r
A fauna que habita a Floresta Estadual de Assis, principalmente de vertebrados e insetos, é a mesma que ocorre na Estação Ecológica de Assis. Animais de grande porte e aves são, inclusive, observados com frequência no sub-bosque das florestas plantadas. Há intensa circulação da fauna entre as duas unidades.