Localizado no município de Iporanga, distando 62 km de sua zona urbana, está a 20 km de Guapiara e 80 km de Apiaí. O Núcleo tem origem em um processo judicial que se prolongou por mais de uma década e teve seu desfecho em 2008, com a reintegração de posse da área em favor do Estado. A implantação do Núcleo, a princípio, teve por objetivo a fiscalização e a pesquisa, e, depois, as atividades educacionais e de recreação. Áreas que sofreram ou sofrem a influência antrópica, tanto por habitantes do entorno quanto por turistas, podem apresentar alterações na fauna e na flora, situação vivida na região. No entanto, foi observada, mesmo reduzida, a presença de mamíferos, como macaco-prego, cachorro-do-mato, furão-pequeno, guaxinim, quati, onça-parda, paca, veado, queixada. O Núcleo Capinzal tem realizado projetos para promover atividades, como o turismo ecológico, a agroecologia e a educação ambiental, visando à integração das comunidades de entorno e ao desenvolvimento socioeconômico local.